Более 20 лет, с 1998 по 2019 гг работал в должности директора по природоохранной политике Всемирного фонда дикой природы (WWF) России. За время работы в Фонде инициировал создание программ: «Климат и энергетика», «Экологическая политика компаний энергетического сектора экономики», «Устойчивое рыболовство», «Экологическое право и госуправление», «Зелёная экономика».
В 1992 г. возглавил создание Благотворительного фонда «Центр охраны дикой природы» (ЦОДП) и до 1998 г. был Председателем совета ЦОДП.
Е.А. Шварц — член Ученого совета Института географии РАН. Автор и соавтор 6 монографий и более 120 публикаций, значительная часть которых опубликована в ведущих научных журналах. Инициатор создания и член редколлегий журналов «Устойчивое лесопользование», «Заповедники и национальные парки» и «Охрана дикой природы», член редколлегии журнала «Экологическое планирование и управление» РАН, а также член редсовета бюллетеня «Использование и охрана природных ресурсов в России (с 2018 г.).
Е. А. Шварц — основатель и председатель Общественного совета Рослесхоза (2005-2017), член Общественного совета Минприроды России и Департамента природопользования и охраны окружающей среды Правительства Москвы (2004-2012), Экспертного совета Комитета Госдумы по природным ресурсам, природопользованию и экологии, с 2006 г. член Экологического и Социального консультативного совета Европейского Банка реконструкции и развития. С 1996 г. – член Всемирной комиссии по охраняемым природным территориям Международного союза охраны природы. В 1996-1998 гг. – управляющий компонентом «Охраняемые природные территории» проекта Глобального экологического фонда «Сохранение биоразнообразия Российской Федерации».
Е.А. Шварц является инициатором и пионером развития в России добровольных, рыночно ориентированных механизмов в области охраны окружающей среды и сохранения биоразнообразии – таких как добровольные сертификации (в первую очередь – добровольная лесная сертификация FSC – Forest Stewardship Council) и различные экологические рейтинги в России. В их числе: «Экологические рейтинги лесопромышленного комплекса РФ» (2004-2006); «Рейтинг государственного управления лесами в субъектах РФ» (2010-2013); «Эколого-экономический индекс субъектов России» (2012); «Экологический след субъектов РФ» (2012, 2016); «Рейтинг экологической открытости нефтегазовых компаний России» (2014-2017); «Рейтинг экологической открытости горнодобывающих компаний России» (2016-2017); «Рейтинг экологической прозрачности ЦБК России» (2017).
В 2010-2011 гг. – сопредседатель Редакционной комиссии Минприроды России по подготовке проекта «Основы государственной политики в области экологического развития Российской Федерации на период до 2030 года», которые были утверждены президентом Д.А. Медведевым 30 апреля 2012 года. Активный участник подготовки проекта «Основы государственной политики в области использования, охраны, защиты и воспроизводства лесов в Российской Федерации на период до 2030 года» (утв. распоряжением Правительства РФ от 26 сентября 2013 г. N 1724-р).
